Forskerne tror, at der er mange mulige anvendelser for en grafen-Josephson-junction. Det kunne for eksempel være en SQUID (Superconducting QuantUm Interference Device). Her er to Josephson junctions forbundet i en ring, hvilket kan bruges til MR-scanning eller i en kvantecomputer.
En SQUID bruges i meget andet end MR scannere og kvantecomputere. Hele ideen i en SQUID er, at bygge en enhed som er ekstremt følsom for magnetfelter. Følsomheden kommer fordi superledende tunnelerende elektroner er ekstremt følsomme overfor magnetfelter når de tunnellerer. Magnetfelter bryder det superledende elektron-par (Cooper / BCS parret), og junctionen skifter fra 0 ohm til afbrudt - dvs. noget som er nemt at måle.
SQUIDs kan i dag laves så følsomme, at de kan detekterer et enkelt flux kvant. Det betyder at man kan bygge meget følsomme antenner, som, f.eks. kan opfange magnetfelter under vand (bruges til kommunikation med u-både), og i satellitter hvor man kan måle magnetfelter i rummet.