blogs kategori-billede

Det personlige genom

Af Astrid Colding Sivertsen,  torsdag 24. sep 2009 kl. 19:06

Da det menneskelige genom i 2005 blev præsenteret med stor fanfare, havde projektet kostet nogle milliarder dollars. Til gengæld havde det Humane Genomprojekt undervejs udviklet teknikken til sekventering af DNA, altså processen hvor man finder rækkefølgen af DNA’ets baser A, T, C og G. Det lyder måske som en triviel proces, men er det langt fra når det drejer sig om det samlede DNA fra et menneske, som indeholder tre milliarder baser.

Da det Humane Genomprojekt var slut, havde det nedbragt prisen for sekventering af et helt genom til 20 millioner dollars. I dag er prisen kommet yderligere ned. Firmaet Knome tilbyder under sloganet ”Know thyself” (plejede det slogan ikke at tilhøre oraklet i Delfi?) sekventering af kundernes genom. 99.500 dollars koster den komplette sekventering af alt kundens DNA, mens man slipper med 24.500 dollars hvis man kun vil kende sekvensen af selve generne. Generne udgør omkring 2% af den samlede mængde DNA, men den virkelig kræsne kunde bør overveje den komplette sekventering. Selv om det er selve generne der koder for proteiner, så skyldes nogle sygdomme defekter i det DNA der ligger udenom generne – det indeholder nemlig koder for regulering af generne.

Som man kan se er der stadig langt ned til guldstandarden indenfor sekventering, det eftertragtede 1000-dollar genom, men mange håber at nå dertil i løbet af mindre end 10 år. Når prisen engang når ned i det leje, er det tanken at vi alle vil have råd til at få vores genomer sekventeret. Hvis vi altså har lyst.

Det har jeg personligt, og simpel nysgerrighed er den ene grund til, at jeg har meldt mig frivilligt til det personlige genomprojekt. Det er et forskningsprojekt, som i sidste ende skal kortlægge 100.000 personers genomer. Opstarten er ganske langsom på grund af den stadigt høje pris, men de første 10 genomer er sekventeret og stillet til rådighed for resten af verden.

Det er en central del af projektet, at den genetiske information skal stilles til rådighed for forskere i hele verden. De kan så arbejde sig igennem materialet, og lede efter sammenhænge mellem gener og egenskaber eller sygdomme. Det er noget vi ikke ved ret meget om i dag. Vi kender mange tilfælde hvor en mutation i et enkelt gen fører til en sygdom, men de fleste egenskaber og sygdomme er (i det omfang de altså skyldes arv frem for miljø) styret af et samspil mellem mange gener. Der findes ikke et IQ-gen, og heller ikke et skizofreni-gen. For at finde så komplekse sammenhænge er der brug for et stort statistisk materiale.

Jeg synes det er vigtig forskning, og det er den anden grund til at jeg har meldt mig frivilligt. Det er et værdigt projekt at give sine gener til, men jeg overvejede det faktisk en del før jeg udfyldte papirerne.

For at datasættet kan bruges til at lede efter sammenhænge mellem gener og sygdomme, så skal deltagere oplyse om alle sygdomme de har eller har haft, samt hvilken medicin de tager. Oplysningerne bliver offentliggjort på projektets hjemmeside sammen med portrætbilleder fra forskellige vinkler og genernes sekvens.

Oplysninger om mine gener er nok ikke direkte brugbare for andre på nuværende tidspunkt, men kan måske blive det i fremtiden – når forskning netop som det personlige genomprojekt har kortlagt hvad bestemte variationer af generne kan betyde. For at deltage i genomprojektet skal man erklære sig indforstået med, at oplysningerne kan blive brugt imod en. At man kan blive fyret, eller miste sin forsikring (ikke godt i et USA, hvor udsigterne til en reform af sygeforsikringen er lange).

Når man sekventerer så mange menneskers genomer er det desuden uundgåeligt at finde gener for alvorlige, dødelige sygdomme, som for eksempel tidlig Alzheimer. Nogle frivillige vil altså få en melding om, at de vil udvikle demens i 40-50-årsalderen.

Alligevel vil jeg gerne deltage. Men jeg kunne godt tænke mig at høre læsernes mening om emnet. Er det vanvittigt at stille op? At få offentliggjort sit genom? Er det overhovedet godt at kende sit genom, eller der nogen der hellere vil leve i lykkelig uvidenhed? Nogen der overvejer selv at stille op til projektet, eller har fået undersøgt deres gener på anden vis?



24. sep 2009 kl 21:17

Claus Madsen

100$ Genom?

Firmaet Pacific Biosciences stiller i udsigt, at de om få år kan sekventere et genom for 100$.
Den teknologi de påstår at råde over er meget original og efter min vurdering lovende.
Se den her: (klik på video linket "Technology Demo" neders på siden)

http://www.pacificbiosciences....tion

Mht. Personal genome projektet, stillede jeg gerne mit DNA til rådighed hvis det blev publiceret i anonymiseret form. Men med foto.... Det er jeg meget betænkelig ved.


25. sep 2009 kl 13:14

Tomas Ussing

Genetisk diskriminering

For at deltage i genomprojektet skal man erklære sig indforstået med, at oplysningerne kan blive brugt imod en. At man kan blive fyret, eller miste sin forsikring (ikke godt i et USA, hvor udsigterne til en reform af sygeforsikringen er lange).

Det bør nævnes at de i US (under Bush regeringen) vedtog den såkaldte "Genetic Non Discrimination Act" der således foreskriver at det er ULOVLIGT at benytte information om genetisk profil i forbindelse med forsikring, arbejde/ansættelse m.v. Det illustrerer i øvrigt fint den symbiose der foregår mellem teknologi udvikling og lovgivning. Man bør ikke forsøge at lovgive imod en given forskning eller teknologiudvikling, men resultatet og anvendelsen af disse fremskridt bør naturligvis diskuteres og reguleres af lovgiverne.


13. okt 2009 kl 20:25

avatar

Astrid Colding Sivertsen

Re: 100$ Genom?

Firmaet Pacific Biosciences stiller i udsigt, at de om få år kan sekventere et genom for 100$.
Den teknologi de påstår at råde over er meget original og efter min vurdering lovende.

Tak for linket, Claus - det er endelig lykkedes mig at finde tid til at læse artiklen, som firmaet udgav i Januar. Publiceret i Science, og det plejer jo ganske rigtigt at tyde på noget originalt/lovende.

Jeg vil dog sige at det er mere lovende end det er en teknologi der får prisen på sekventering til at styrtdykke lige med det første...

Måden de laver single molecule detection på er, at de immobiliserer en (et molekyle) DNA polymerase i en brønd, giver den et stykke DNA at lave en kopi af, og så læser fluorescensen fra fire base-analoger (A, T, C og G) idet de er bundet til polymerasen.

Det virker nogenlunde. De viser nemlig data for et stykke DNA der er 158 bogstaver langt, og her bliver kun 131 læst korrekt af systemet. Problemet er primært DNA polymerasen selv, så deres løsningsforslag er modifikation af polymerasen så den binder hvert nukleotid lidt længere. Sådan noget tager tid og penge!

Jeg vil give dig ret i, at dette er et virkelig interessant proof-of-concept. Folk har talt om det i årevis allerede, og det er meget sandsynligt at DNA-sekventering går over til at være single molecule detection. Men der er stadig mange børnesygdomme der skal overstås.


13. okt 2009 kl 22:55

Claus Madsen

Re: Re: 100$ Genom?

Det var så lidt :)
Ja. Det varer nok lidt før den teknologi kan kommercialiseres. Jeg har i tillæg til hvad du nævner hæftet mig ved at de tilsyneladende fortrækker at sekventere enkeltstrenget syntestisk DNA. Det tyder lidt på at der mangler udvikning af metoder til at håndtere dobbeltstrenget DNA i systemet.

Men jeg ser ingen uoverkommelige problemer og mon ikke investorpengene sidder lidt løsere efter puplikationen i januar? Jeg tager et vildt skud og siger 5 år.

Forresten, appropos det med at lade sig sekventere personligt. Har du hørt om "geneographic" projektet:

https://genographic.nationalge....htm

Her kan man også melde sig frivilligt. Ikke til at blive sekventeret, men til vha. en mindre detaljeret DNA analyse at blive indplaceret i menneskelighedens phylogenetiske træ.
Det skulle også kunne afsløre noget om ens forfædres folkevandringer. Ja, helt tilbage til Afrika siges det.
Bagsiden er at det koster 100$ at deltage. Men så får man også en DVD og noget gejl.


13. okt 2009 kl 23:20

Tomas Ussing

Re: Re: Re: 100$ Genom?

Men der er stadig mange børnesygdomme der skal overstås.

(...)


Men jeg ser ingen uoverkommelige problemer og mon ikke... og siger 5 år

Jeg vil ikke være sortseer, men der er hverken tale om kategori "børnesydomme" eller om noget der bare ligner 5 års yderligere fintuning og iterering. Det ser fint ud med Flash-animationer og teoretiske analyser, men vi tangerer her (næsten) "carbon-nanotube stigen til månen" og de "sygdomskurerende nanorobotter" i forhold til at få produktet på gaden i et realistisk økonomisk rentabelt format.


14. okt 2009 kl 00:09

Stephan Engberg

Lovligt at drikke sig ihjel

Er det vanvittigt at stille op? Tjahh .. det er jo et frit valg.

Det største problem er at det rammer andre ved dels at det rammer familliemedlemmer og dels at det misbruges til at skabe opfattelsen af at biometrisk overvågning på nogen måde kan gavne samfundet.

Som helt generelt grundprincip bør ingen biometri på noget tidspunkt kunne henføres digitalt til en specifik person. Misbrugsmulighederne specielt de sikkerhedsrelaterede trusler er så store at det kun drejer om hvornår, ikke om hvorvidt det misbruges til skade for vedkommende.

Men det er jo heller ikke nødvendigt for at kunne løse problemer. Man skal blot sikre at biometrien isoleres fra identiteten og opretholde forbrudet mod at opsamle biometri eller lagre personhenførbar biometri. Se f.eks. her fra ICT Privacy konferencen i Industriens Hus for et par uger siden.
http://www.ambafrance-dk.org/s...3558


14. okt 2009 kl 08:25

Tomas Ussing

Re: Lovligt at drikke sig ihjel

Takker for linket Stephan. Det bidrager væsentligt til debatten vedr. den humane diversitet ;-)


Ny i debatten? Opret en brugerkonto

  • Seneste nyt
  • Mest læste
  • Debatterede
 

Nyhedsbrev

Tilmeld dig vores nyhedsbrev.